En México no hay motores diesel FIAT de baja cilindrada, solo 2.3 y 3.0 para Ducato; ese motor que comentas no lo conozco pero te recomiendo que uses las herramientas especiales para sincronizar el motor ya que podría haber variación como en tu caso
Antes de desarmar debiste poner tus marcas, o por otro lado debes usar herramientas para sincronizar; antes de sincronizar debes investigar sobre el. Otro que vas a trabajar y no hacerlo sin tener información y seguir las recomendaciones mínimas de cualquier mecánico preparado que es colocar marcas de referencia antes de meter mano, suerte 😏