Tengo un Ford focus 2005 automático y hace algunos meses le cambie el motor por uno más fuerte el del fusion 2006 y todo al 100%

Bueno...
El primer problema es que no puedo correrlo arriba de 110 km porque empieza a fallar (perdida de potencia y se apaga )

Y el segundo problema fue que el día de ayer me quede sin pila y al conectarle los cables los cruzaron por un milisegundo al chispazo con la batería desconectaron (+con- y viceversa) y el auto ya no quiso encender

Revise
El cajón de fusibles del motor y el que esta dentro de la cabina todos funcionan bien
Se escucha el zumbido de la bomba quiere decir que no es falla en ella
Cual pudiera ser el fallo alguien sabe ?