Vamos por la temperatura.
El Bora es algo complicado para realizar purga del sistema de enfriamientos, es importante que si les genera alta temperatura, luego de algún reemplazo de manguera o pieza inherente al sistema de enfriamientos, deben asegurarse que el sistema quede sin aire en las vías. Por otra parte, suele ocurrir, que en las mangueras de menor diámetro se generen residuos propios del agua, si no aplica refrigerante.
Caja:

Si la caja registra un golpeteo entre 20 / 40 y 60, no dando resultados en la computadora, lo mas probable es que el arnés que va desde la computadora de la caja, para modelo hidromático (Automático) este averiado, el mismo posee un recubrimiento muy fragíl a la tempretura, convirtiendo el protector del conductor en algo como una plastilina con color y apariencia similar, una vez que esto ocurre, si reemplaza las lineas o arnés y persiste el sistema, lo mas probable es que exista avería en la computadora de la caja. Es importante que de reemplazar, ubique el código de igual especificación de su modelo, porque de no ser así los cambios no se realizaran en los valores normales entre 20/40/60. Espero esto les sirva de ayuda. Muy buen vehículo, pero es muy fragíl el diseño de algunas partes, comparado con otros modelo o marcas. @frankpalencia